Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms