Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms