Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YYE9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0J9YYE9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0J9YYE9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0J9YYE9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0J9YYE9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0J9YYE9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0J9YYE9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0J9YYE9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0J9YYE9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0J9YYE9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0J9YYE9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0J9YYE9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0J9YYE9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0J9YYE9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0J9YYE9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0J9YYE9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0J9YYE9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A0J9YYE9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A0J9YYE9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A0J9YYE9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms