Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PCDHGA7-201ENST00000518325 4605 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 EIF3A-203ENST00000541549 4495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 LPIN2-201ENST00000261596 6229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 HECTD4-202ENST00000377560 15759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 FAN1-201ENST00000362065 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SRGAP2C-202ENST00000367123 7204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PNMA3-203ENST00000619635 3627 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SLFNL1-202ENST00000359345 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 WASF2-202ENST00000618852 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TIPARP-202ENST00000461166 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 GOLGA8CP-201ENST00000446144 5237 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 GOLGA8F-201ENST00000526619 5237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SEMA6D-204ENST00000358066 5913 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 C2CD2-201ENST00000329623 5844 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TACC2-229ENST00000515603 9101 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ASPH-208ENST00000517856 6337 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms