Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 EFHD1-203ENST00000409708 1817 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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HERC3Q15034 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 DBF4B-202ENST00000393547 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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