Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTMAP06454 KCTD21-AS1-207ENST00000600795 1549 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTMAP06454 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTMAP06454 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTMAP06454 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTMAP06454 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTMAP06454 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTMAP06454 CTCFL-204ENST00000422869 2966 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTMAP06454 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTMAP06454 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTMAP06454 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTMAP06454 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTMAP06454 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTMAP06454 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTMAP06454 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTMAP06454 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTMAP06454 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTMAP06454 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTMAP06454 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTMAP06454 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTMAP06454 AC099786.2-201ENST00000427892 2203 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTMAP06454 LINC01106-201ENST00000436665 2244 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTMAP06454 YLPM1-201ENST00000325680 7108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTMAP06454 FAM90A17P-201ENST00000533716 1957 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTMAP06454 SHPRH-201ENST00000275233 6649 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTMAP06454 DGKH-202ENST00000337343 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTMAP06454 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTMAP06454 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTMAP06454 POTEI-203ENST00000631234 2072 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTMAP06454 BBOF1-201ENST00000394009 3106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTMAP06454 POFUT2-203ENST00000349485 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTMAP06454 AL449403.1-201ENST00000432783 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTMAP06454 ACOT11-201ENST00000343744 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTMAP06454 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTMAP06454 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 ANXA11-202ENST00000372231 6720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 AC105402.3-202ENST00000446781 2592 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 LIG1-201ENST00000263274 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 RAVER1-201ENST00000293677 3595 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 FAM131A-211ENST00000639617 4450 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 MARCH10-209ENST00000583600 3214 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 FBLN2-201ENST00000295760 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 FAM102A-203ENST00000373095 4144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 ARHGEF3-213ENST00000496106 1994 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 VWC2-201ENST00000340652 11299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 FLCN-201ENST00000285071 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 NUP62-208ENST00000596217 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 RIMKLA-202ENST00000431473 8909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 GSN-205ENST00000373823 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 ELMOD3-202ENST00000393852 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 AL109976.1-201ENST00000621919 5678 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 RIC8A-203ENST00000526104 3703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 HERC2P3-204ENST00000426501 5995 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 BDNF-215ENST00000530861 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTMAP06454 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 LDLR-207ENST00000558013 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 SLC44A1-201ENST00000374720 10511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 TMCC2-208ENST00000545499 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 UNC13D-202ENST00000412096 3648 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 NFXL1-202ENST00000381538 3728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 UBXN4-201ENST00000272638 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 DOCK4-204ENST00000428084 7997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 LCMT2-201ENST00000305641 6957 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTMAP06454 PRAMENP-201ENST00000337471 3038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms