Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 PLP2-201ENST00000376322 620 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 ITPKB-IT1-201ENST00000412918 746 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AC074085.2-201ENST00000416734 428 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 RN7SL292P-201ENST00000473305 266 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 RN7SL342P-201ENST00000479616 294 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AC104123.1-201ENST00000502645 473 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AC245884.7-201ENST00000514037 356 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AC087752.3-201ENST00000523905 709 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 MEG3-223ENST00000524131 721 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AC034102.3-201ENST00000551846 300 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 MAP3K14-AS1-207ENST00000588698 460 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 EIF3LP1-201ENST00000554099 1658 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 NAP1L1-206ENST00000544816 1597 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AL109615.2-201ENST00000455005 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 MIA-201ENST00000263369 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 MIR345-201ENST00000362114 98 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 RN7SKP170-201ENST00000362550 328 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 C2orf70-202ENST00000409392 764 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 LINC01044-201ENST00000413637 657 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AL356488.1-201ENST00000429752 609 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AL589843.2-201ENST00000445872 1262 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 BNC2-207ENST00000471301 745 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AC104371.1-201ENST00000522077 797 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AC020663.2-201ENST00000592465 720 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 MIA-203ENST00000594436 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AC003005.2-201ENST00000595422 539 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 NAA50-203ENST00000477813 1945 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 ELMOD3-201ENST00000315658 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 SLC37A3-203ENST00000447932 3254 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 GMPR2-201ENST00000348719 1684 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 JPX-207ENST00000602772 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 USP4-204ENST00000416417 1536 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 KRTAP9-10P-201ENST00000435672 207 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 LAMTOR5-203ENST00000474861 1154 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 RPL10P13-201ENST00000550757 303 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AC009166.1-201ENST00000570060 487 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 NOSIP-204ENST00000596358 1005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 VRK3-202ENST00000377011 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 HPRT1-201ENST00000298556 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 HNRNPA1P19-201ENST00000405292 370 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 LINC00337-202ENST00000441724 1138 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 ZEB2P1-201ENST00000515048 1141 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 LINC02395-202ENST00000547443 724 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 AC008870.3-201ENST00000566143 641 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 AC015911.7-201ENST00000587542 958 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 SRP9-205ENST00000626563 329 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
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