Protein–RNA interactions for Protein: P20936

RASA1, Ras GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA1P20936 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASA1P20936 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASA1P20936 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASA1P20936 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASA1P20936 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASA1P20936 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASA1P20936 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASA1P20936 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASA1P20936 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASA1P20936 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 OR2T32P-201ENST00000403423 963 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 AC079336.3-201ENST00000577227 475 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 NAMA-207ENST00000605707 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASA1P20936 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 Z98259.1-201ENST00000564261 1697 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASA1P20936 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms