Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI67

KRTAP6-3, Keratin-associated protein 6-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP6-3Q3LI67 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 CXorf40A-203ENST00000422892 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 AGPAT4-IT1-201ENST00000624499 1878 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 HNRNPA1P6-202ENST00000631770 1447 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 PILRA-201ENST00000198536 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 TM2D3-202ENST00000347970 1329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 SOHLH2-201ENST00000317764 1909 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 NPAP1P3-201ENST00000432327 1586 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 SETDB1-202ENST00000368962 1478 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 LINC02002-201ENST00000578977 1481 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 HNRNPA2B1-202ENST00000356674 1711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 IGF2BP2-203ENST00000421047 1711 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 ATL2-206ENST00000419554 2335 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 ERGIC3-202ENST00000348547 1359 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 C14orf159-202ENST00000298858 642 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 DEFB103A-201ENST00000314357 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 DEFB103B-201ENST00000318124 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 MRPL55-203ENST00000336520 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 UBE2D3-206ENST00000357194 660 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 S100A4-202ENST00000368714 531 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 NDUFB8-203ENST00000370322 713 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 DEFA1-201ENST00000382679 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 HLA-DRA-202ENST00000395388 1280 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 STSP1-201ENST00000412493 1151 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 PGAM1P7-201ENST00000413837 737 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 AC011247.1-202ENST00000417039 1156 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 TGFA-203ENST00000418333 1225 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 GHRL-203ENST00000422159 401 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 AL592049.1-201ENST00000422490 1188 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 AC010883.1-201ENST00000423354 398 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 HSPD1P6-202ENST00000424886 571 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 AC092810.1-201ENST00000429208 1224 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 MRPL55-221ENST00000430433 864 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 NDUFB9P2-201ENST00000431248 507 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 AC002451.1-202ENST00000432265 771 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 TAS2R62P-201ENST00000433466 940 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 AC099066.3-201ENST00000434499 301 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 HACL1-206ENST00000435217 1269 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 RPL3P1-201ENST00000437106 1211 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 AC073911.1-202ENST00000443154 1151 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 AL358613.1-201ENST00000444965 442 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP6-3Q3LI67 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms