Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 DAPK1-IT1-201ENST00000431813 702 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 ATF4P3-201ENST00000433309 1056 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 Z93242.2-201ENST00000445666 394 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 RNF139-AS1-202ENST00000519861 359 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 AC091941.1-201ENST00000623003 576 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 AC244517.2-204ENST00000624802 415 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 C2-211ENST00000469372 1906 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 OLAH-203ENST00000378228 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 MAGEA9B-203ENST00000595065 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 OR9G1-201ENST00000312153 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 AC245128.2-201ENST00000412970 284 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 IL1RAP-210ENST00000434491 1565 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 LINC00337-202ENST00000441724 1138 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 LINC01524-202ENST00000454600 745 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 TCP10-205ENST00000476779 646 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 SNHG14-220ENST00000553149 513 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 AC007923.4-201ENST00000578650 568 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 MIR4725-201ENST00000581700 90 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NESP48681 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NESP48681 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NESP48681 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NESP48681 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NESP48681 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NESP48681 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NESP48681 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NESP48681 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NESP48681 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NESP48681 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NESP48681 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NESP48681 CYP2F2P-201ENST00000437853 1056 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NESP48681 AC011005.1-201ENST00000467614 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NESP48681 BIN3-210ENST00000522268 321 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NESP48681 NARF-IT1-201ENST00000584012 769 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NESP48681 HKR1-222ENST00000591417 525 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NESP48681 AC092301.1-201ENST00000601618 764 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NESP48681 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NESP48681 FHL2-208ENST00000409807 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NESP48681 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NESP48681 FAM156A-203ENST00000611661 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NESP48681 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NESP48681 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NESP48681 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NESP48681 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NESP48681 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NESP48681 ADPRH-202ENST00000465513 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NESP48681 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NESP48681 SLC25A19-204ENST00000416858 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NESP48681 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NESP48681 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NESP48681 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NESP48681 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NESP48681 CD300A-201ENST00000310828 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NESP48681 CHMP2A-201ENST00000312547 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NESP48681 AP4S1-203ENST00000334725 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NESP48681 VSTM1-202ENST00000366170 654 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NESP48681 HLA-DQB1-203ENST00000399082 1219 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NESP48681 AC015909.2-201ENST00000523083 547 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NESP48681 AC124947.1-201ENST00000552835 814 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NESP48681 PSME1-210ENST00000561435 945 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NESP48681 AC004702.1-201ENST00000580225 195 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NESP48681 CHMP2A-206ENST00000600118 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NESP48681 AL627230.7-201ENST00000613971 601 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NESP48681 GALNTL6-207ENST00000616459 1254 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NESP48681 AC012186.3-201ENST00000623850 485 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NESP48681 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NESP48681 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NESP48681 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NESP48681 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NESP48681 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NESP48681 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NESP48681 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NESP48681 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NESP48681 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NESP48681 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NESP48681 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NESP48681 KRT8P46-201ENST00000512037 1426 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NESP48681 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NESP48681 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NESP48681 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NESP48681 UGT1A1-201ENST00000305208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NESP48681 ACTG1-216ENST00000615544 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms