Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 AL137779.3-201ENST00000553295 729 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 CPA5-203ENST00000461828 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC27P30260 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC27P30260 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC27P30260 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC27P30260 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC27P30260 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC27P30260 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC27P30260 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC27P30260 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC27P30260 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC27P30260 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC27P30260 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC27P30260 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC27P30260 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC27P30260 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC27P30260 AL391097.1-201ENST00000432706 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC27P30260 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC27P30260 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC27P30260 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC27P30260 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC27P30260 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC27P30260 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC27P30260 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms