Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms