Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 RGS6-203ENST00000402788 5400 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AC138150.2-201ENST00000589796 2053 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 MYO1C-202ENST00000361007 4734 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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