Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AP001625.3-201ENST00000416179 449 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AGAP13P-201ENST00000417888 363 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AC018511.1-201ENST00000436608 380 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AC074366.1-204ENST00000446277 552 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AL356479.1-202ENST00000456933 714 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AC091893.1-201ENST00000503772 399 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 FGL1-206ENST00000518650 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 IGHV3-60-201ENST00000521678 354 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AP001107.8-201ENST00000530805 479 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 RPL38-206ENST00000533498 532 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 Metazoa_SRP.85-201ENST00000610909 260 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 SPDL1-216ENST00000629457 340 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AL358215.3-201ENST00000640695 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 SEC22C-205ENST00000417572 1513 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 HFE-204ENST00000349999 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AL391097.1-201ENST00000432706 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 RPL15-202ENST00000354811 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 MRPL55-212ENST00000366739 641 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 SYCE3-201ENST00000402753 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 APOBEC3H-203ENST00000421988 592 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 SSR3-202ENST00000463503 596 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 RN7SL756P-201ENST00000488739 268 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AC003072.1-201ENST00000510957 612 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 KIAA1191-211ENST00000533553 560 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 ZEB1-AS1-207ENST00000606286 476 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 Metazoa_SRP.198-201ENST00000610617 323 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 PSMB3-211ENST00000619426 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 GMNN-207ENST00000620958 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AC109826.1-203ENST00000624259 1105 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 ARL14EPL-203ENST00000634632 642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GLI3P10071 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GLI3P10071 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AC106872.1-201ENST00000512492 1360 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GLI3P10071 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AC005549.1-201ENST00000579438 1629 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GLI3P10071 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GLI3P10071 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GLI3P10071 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GLI3P10071 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GLI3P10071 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GLI3P10071 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GLI3P10071 CST2-201ENST00000304725 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GLI3P10071 KRTAP13-1-201ENST00000355459 749 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AL356414.1-201ENST00000379526 686 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GLI3P10071 CTSLP1-201ENST00000457530 1002 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GLI3P10071 IGHV3-6-201ENST00000518407 347 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GLI3P10071 FAM86B1-215ENST00000533513 725 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AC126471.1-201ENST00000550676 362 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GLI3P10071 PSME2-213ENST00000560410 755 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GLI3P10071 LINC02074-201ENST00000581028 569 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GLI3P10071 LINC02074-202ENST00000584003 573 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GLI3P10071 MIR6750-201ENST00000617817 75 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GLI3P10071 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GLI3P10071 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GLI3P10071 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GLI3P10071 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GLI3P10071 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 ARRB2-207ENST00000571206 1659 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 SLC37A3-203ENST00000447932 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 HP-203ENST00000357763 1482 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 SCARB2-202ENST00000452464 1495 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 CDK7-202ENST00000502604 1455 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 MYL2-201ENST00000228841 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 EXOC7-206ENST00000406660 718 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 FAM45BP-201ENST00000408950 1074 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 ALDH7A1-203ENST00000413020 1126 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AC074085.2-201ENST00000416734 428 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 TGIF2P1-201ENST00000435390 685 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms