Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 LPGAT1-202ENST00000366997 7782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TNC-201ENST00000341037 6786 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SLC36A4-201ENST00000326402 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 NDST1-201ENST00000261797 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SCN5A-209ENST00000451551 8343 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 BIVM-ERCC5-204ENST00000639132 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 RBM20-201ENST00000369519 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PCDHAC1-201ENST00000253807 5299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AREL1-201ENST00000356357 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 BAG5-203ENST00000445922 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 LAMA4-201ENST00000230538 6547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ACAN-206ENST00000559004 7628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PLEKHA6-202ENST00000414478 5091 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TCF21-202ENST00000367882 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SCN5A-205ENST00000423572 8362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms