Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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HOXA3O43365 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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HOXA3O43365 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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HOXA3O43365 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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HOXA3O43365 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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HOXA3O43365 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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HOXA3O43365 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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