Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms