Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LTAP01374 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LTAP01374 EXOC7-207ENST00000411744 2031 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LTAP01374 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LTAP01374 TTN-AS1-209ENST00000456053 2033 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LTAP01374 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LTAP01374 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LTAP01374 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LTAP01374 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LTAP01374 GRIA4-202ENST00000393125 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LTAP01374 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LTAP01374 POM121L7P-201ENST00000329949 2404 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LTAP01374 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LTAP01374 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LTAP01374 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LTAP01374 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LTAP01374 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LTAP01374 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LTAP01374 SUCO-209ENST00000610051 2925 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LTAP01374 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.75
LTAP01374 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 TPO-204ENST00000382198 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 GOLGA6L7P-201ENST00000567390 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 PLA2G4E-AS1-201ENST00000499478 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 ZMIZ2-215ENST00000615423 2772 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 AC022098.1-201ENST00000588387 2861 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 C1QTNF9B-202ENST00000382140 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 ARHGEF9-235ENST00000637723 2146 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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LTAP01374 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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LTAP01374 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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LTAP01374 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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LTAP01374 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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LTAP01374 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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LTAP01374 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 GALT-201ENST00000378842 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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LTAP01374 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 FAM95C-205ENST00000637556 2421 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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LTAP01374 LINC00908-202ENST00000578613 2242 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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LTAP01374 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LTAP01374 KCNH1-205ENST00000638498 3479 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LTAP01374 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LTAP01374 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LTAP01374 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LTAP01374 TEX35-203ENST00000367641 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LTAP01374 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LTAP01374 ANKRA2-201ENST00000296785 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LTAP01374 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LTAP01374 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LTAP01374 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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