Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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