Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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AP3M2P53677 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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AP3M2P53677 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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AP3M2P53677 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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AP3M2P53677 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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AP3M2P53677 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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