Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BCAMP50895 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BCAMP50895 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BCAMP50895 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BCAMP50895 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BCAMP50895 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BCAMP50895 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BCAMP50895 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
BCAMP50895 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
BCAMP50895 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCAMP50895 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCAMP50895 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCAMP50895 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCAMP50895 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCAMP50895 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCAMP50895 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCAMP50895 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCAMP50895 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCAMP50895 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCAMP50895 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCAMP50895 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms