Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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HOXA3O43365 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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HOXA3O43365 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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HOXA3O43365 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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HOXA3O43365 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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HOXA3O43365 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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