Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AL591926.3-201ENST00000611630 238 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms