Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC009041.1-202ENST00000599946 987 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AC012594.1-273ENST00000626618 816 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AC106872.9-201ENST00000512437 1393 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 RPSAP61-201ENST00000412542 878 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 AC010395.2-201ENST00000509899 904 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 FAR1-IT1-201ENST00000525233 368 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 HAX1-211ENST00000532105 771 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 MIR5193-201ENST00000584510 109 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 AC245427.1-201ENST00000633705 760 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 COPS5-203ENST00000517736 1621 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXQ1Q9C009 LINC01137-201ENST00000424989 1395 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms