Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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SPOCK3Q9BQ16 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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SPOCK3Q9BQ16 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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SPOCK3Q9BQ16 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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SPOCK3Q9BQ16 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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SPOCK3Q9BQ16 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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SPOCK3Q9BQ16 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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SPOCK3Q9BQ16 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 LRCH1-203ENST00000389798 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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SPOCK3Q9BQ16 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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