Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 PLAGL1-209ENST00000444202 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 FAM47DP-201ENST00000402340 3290 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 MATN2-218ENST00000524308 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 CLK3-201ENST00000345005 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 PKM-222ENST00000568883 1863 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 SHC1-203ENST00000368449 2879 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 DYNC1I1-205ENST00000447467 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 TXNRD1-201ENST00000354940 4082 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 ZNF266-206ENST00000592292 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 SIGLEC11-203ENST00000447370 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 NSUN4-204ENST00000474844 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 FOSB-203ENST00000443841 3346 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 SLC38A1-202ENST00000439706 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 ZSCAN20-202ENST00000373413 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 PML-207ENST00000435786 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 NRF1-201ENST00000223190 2424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 TRPC7-203ENST00000502753 2424 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 C2orf69-201ENST00000319974 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 RIOK3-201ENST00000339486 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 P4HA1-201ENST00000263556 2844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 P4HA1-204ENST00000394890 2844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 RPS24-204ENST00000440692 2814 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 GPD1-201ENST00000301149 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 TRIM37-202ENST00000393065 3548 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 C12orf74-201ENST00000397833 1856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 KRT17P7-202ENST00000582261 2334 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 NBPF1-203ENST00000430580 5932 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 POFUT2-213ENST00000612472 2959 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 RASAL1-203ENST00000446861 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 GRM8-201ENST00000339582 4057 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 RAB8B-201ENST00000321437 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R8-201ENST00000236412 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 CDK16-201ENST00000276052 3016 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms