Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 AL591368.1-201ENST00000437181 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 SUCLG2-204ENST00000493112 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 ZNF582-201ENST00000301310 2824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 BSCL2-203ENST00000360796 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 OPRM1-210ENST00000452687 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 OR52N1-201ENST00000317078 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 MIR193A-201ENST00000384882 88 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 AL137077.1-201ENST00000442115 528 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 RN7SL16P-201ENST00000476316 269 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 RN7SL87P-201ENST00000497657 288 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 AC079340.2-201ENST00000504957 495 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 MIF4GD-214ENST00000618645 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 GPHB5-202ENST00000621500 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 AC073592.10-201ENST00000624789 597 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PTCH1Q13635 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PTCH1Q13635 AL391097.1-201ENST00000432706 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 BX088651.4-202ENST00000428895 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 AL590399.1-202ENST00000429818 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 AL512625.1-202ENST00000476224 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PTCH1Q13635 PRDX1-202ENST00000319248 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PTCH1Q13635 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 SERPINI1-202ENST00000446050 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PTCH1Q13635 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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