Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 HKR1-204ENST00000544914 2854 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 RAB3IP-201ENST00000247833 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 KCNMA1-265ENST00000639591 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 INAVA-201ENST00000367342 4298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 ZIK1-202ENST00000536878 4144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 PDHA1-206ENST00000422285 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 FOSB-203ENST00000443841 3346 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 USP10-219ENST00000570191 2717 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 CNGA3-203ENST00000393504 3841 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 CHST4-202ENST00000539698 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 CDK16-201ENST00000276052 3016 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 NCDN-202ENST00000373243 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 SUGP1-201ENST00000247001 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AC092802.1-201ENST00000421762 2447 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 LINC01471-201ENST00000461398 3079 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 HEY2-202ENST00000368365 2461 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 UCK1-202ENST00000372210 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 RNF34-203ENST00000392465 2051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 BEST3-201ENST00000266661 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 ZNF766-202ENST00000593612 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 ZSCAN30-202ENST00000420878 4323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AL132656.4-201ENST00000623504 2122 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 FP565260.1-201ENST00000617716 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 TSPYL2-201ENST00000375442 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 TRIM37-202ENST00000393065 3548 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 EXD2-206ENST00000409949 2688 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 SEC24A-201ENST00000322887 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 ZC3H3-201ENST00000262577 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 TNFSF13B-201ENST00000375887 2582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 EDRF1-201ENST00000337623 4387 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 DCT-202ENST00000446125 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AC097652.1-201ENST00000511385 2114 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 UBA3-202ENST00000361055 2154 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 CWC22-202ENST00000410053 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 HECTD3-201ENST00000372168 2530 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AC093525.7-201ENST00000569852 3626 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 LINC00668-204ENST00000580197 2343 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 SLC38A1-206ENST00000549049 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 POC1B-GALNT4-202ENST00000548729 5436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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