Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms