Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOSBP53539 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOSBP53539 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOSBP53539 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOSBP53539 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOSBP53539 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOSBP53539 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOSBP53539 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOSBP53539 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOSBP53539 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOSBP53539 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOSBP53539 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOSBP53539 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOSBP53539 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOSBP53539 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOSBP53539 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOSBP53539 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOSBP53539 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOSBP53539 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOSBP53539 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOSBP53539 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOSBP53539 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FOSBP53539 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FOSBP53539 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FOSBP53539 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FOSBP53539 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FOSBP53539 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FOSBP53539 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FOSBP53539 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 CCDC152-202ENST00000388827 1237 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 HMGB1P8-201ENST00000558211 949 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOSBP53539 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOSBP53539 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOSBP53539 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOSBP53539 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOSBP53539 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOSBP53539 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOSBP53539 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOSBP53539 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOSBP53539 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOSBP53539 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOSBP53539 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOSBP53539 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOSBP53539 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms