Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms