Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 OAZ3-202ENST00000400999 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 POU5F1-202ENST00000441888 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 OR2A15P-201ENST00000463814 900 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 GOSR1-205ENST00000467337 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 RN7SL16P-201ENST00000476316 269 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AC044839.1-201ENST00000532307 541 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 EIF5A-207ENST00000572815 811 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AC007274.3-201ENST00000619838 385 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AC006511.4-201ENST00000631571 561 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 TSGA13-201ENST00000356588 1372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AL139424.2-202ENST00000641335 1369 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 PSAT1-201ENST00000347159 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 KRTAP10-11-201ENST00000334670 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 IGHV1OR15-9-201ENST00000338912 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 7SK.1-201ENST00000365328 331 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 NR0B1-201ENST00000378963 475 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 RN7SL111P-201ENST00000468841 285 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 PRDX2P3-201ENST00000515779 586 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AP001979.2-201ENST00000526254 975 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AL133453.1-201ENST00000554055 581 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 MRPL34-206ENST00000602206 603 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AL109983.1-201ENST00000603234 646 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 IGHD-202ENST00000613640 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 MGST3-214ENST00000627653 1130 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AC021072.1-201ENST00000635789 835 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AL590094.1-206ENST00000635959 478 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AL590094.1-209ENST00000637260 499 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 KRT18P45-201ENST00000515347 1333 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLD1P28340 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 SPINK2-201ENST00000248701 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AC004884.1-201ENST00000393647 319 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 SATB2-AS1-202ENST00000441234 468 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AC007690.1-201ENST00000451924 468 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 PGAM5-202ENST00000454808 1084 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AP001979.1-201ENST00000529222 751 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AP003108.1-201ENST00000534856 554 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms