Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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ARL2-SNX15V9GYD0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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ARL2-SNX15V9GYD0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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ARL2-SNX15V9GYD0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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ARL2-SNX15V9GYD0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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