Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00312Q9Y6C7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms