Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GTF3C3Q9Y5Q9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms