Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B0

CTDP1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1Q9Y5B0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTDP1Q9Y5B0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTDP1Q9Y5B0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms