Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P8

SIT1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIT1Q9Y3P8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SIT1Q9Y3P8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIT1Q9Y3P8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIT1Q9Y3P8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIT1Q9Y3P8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIT1Q9Y3P8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIT1Q9Y3P8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIT1Q9Y3P8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIT1Q9Y3P8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SIT1Q9Y3P8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIT1Q9Y3P8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIT1Q9Y3P8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIT1Q9Y3P8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIT1Q9Y3P8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIT1Q9Y3P8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SIT1Q9Y3P8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIT1Q9Y3P8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SIT1Q9Y3P8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIT1Q9Y3P8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIT1Q9Y3P8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIT1Q9Y3P8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIT1Q9Y3P8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIT1Q9Y3P8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SIT1Q9Y3P8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIT1Q9Y3P8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIT1Q9Y3P8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SIT1Q9Y3P8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SIT1Q9Y3P8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIT1Q9Y3P8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIT1Q9Y3P8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIT1Q9Y3P8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIT1Q9Y3P8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms