Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP1Q9Y3L3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms