Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
THRAP3Q9Y2W1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
THRAP3Q9Y2W1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms