Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2H6

FNDC3A, Fibronectin type-III domain-containing protein 3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3AQ9Y2H6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC3AQ9Y2H6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms