Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ERVW-1Q9UQF0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERVW-1Q9UQF0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVW-1Q9UQF0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms