Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP1Q9UPQ3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms