Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL4

PLXNB3, Plexin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB3Q9ULL4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNB3Q9ULL4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms