Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NRXN1Q9ULB1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
NRXN1Q9ULB1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC31.76■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
NRXN1Q9ULB1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms