Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DSEQ9UL01 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSEQ9UL01 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms