Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLCO3A1Q9UIG8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLCO3A1Q9UIG8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLCO3A1Q9UIG8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLCO3A1Q9UIG8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLCO3A1Q9UIG8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLCO3A1Q9UIG8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLCO3A1Q9UIG8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLCO3A1Q9UIG8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLCO3A1Q9UIG8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLCO3A1Q9UIG8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLCO3A1Q9UIG8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLCO3A1Q9UIG8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLCO3A1Q9UIG8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLCO3A1Q9UIG8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms