Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VTI1BQ9UEU0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VTI1BQ9UEU0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VTI1BQ9UEU0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms