Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PPARGC1AQ9UBK2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPARGC1AQ9UBK2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms