Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3GQ9NS98 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3GQ9NS98 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3GQ9NS98 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3GQ9NS98 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3GQ9NS98 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3GQ9NS98 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3GQ9NS98 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3GQ9NS98 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3GQ9NS98 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3GQ9NS98 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3GQ9NS98 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3GQ9NS98 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3GQ9NS98 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3GQ9NS98 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3GQ9NS98 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3GQ9NS98 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3GQ9NS98 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3GQ9NS98 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3GQ9NS98 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3GQ9NS98 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3GQ9NS98 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3GQ9NS98 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3GQ9NS98 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3GQ9NS98 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms