Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SH2B1Q9NRF2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SH2B1Q9NRF2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SH2B1Q9NRF2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SH2B1Q9NRF2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SH2B1Q9NRF2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SH2B1Q9NRF2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SH2B1Q9NRF2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SH2B1Q9NRF2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SH2B1Q9NRF2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SH2B1Q9NRF2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SH2B1Q9NRF2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SH2B1Q9NRF2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SH2B1Q9NRF2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SH2B1Q9NRF2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SH2B1Q9NRF2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SH2B1Q9NRF2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SH2B1Q9NRF2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SH2B1Q9NRF2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SH2B1Q9NRF2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH2B1Q9NRF2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms